火影忍者许愿宝库的保底机制是在抽奖一定次数后可以免费领取一片S级忍者，并且还会随机获得几片S级忍者碎片。根据具体的抽奖规则，需要抽奖300次才能保底出一个S级忍者。每次抽奖可以获得10个许愿币，而一片S级忍者碎片需要30个许愿币，所以在抽奖300次后可以获得3000个许愿币，正好可以兑换一片S级忍者。因此，保底出一个S级忍者需要抽奖300次，也就是说需要50400金币。

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