在战神学院中，不同志向的天启者们分为了多个学院系别，玩家可以选择其中一个加入并进行学分的修行，达到一定阶段后还可以获取学院内的宝物，激活强大的主动技能。
可供选择的学院如下：
星仪学院：由诸葛亮为首创建的学院，主修天文知识。
齐民学院：为了繁荣而创建的学院，主修经济知识。
月令学院：由华佗创办的学院，主修医药农业知识。
雷霆学院：由张飞率领的学院，主修军事知识。
文经学院：曹植带领的学院，主修文学