玩家化身若叶镇的少年训练家，从空木博士手中挑选初始宝可梦，开启城都地区的冒险。前期剧情高度还原原作，依次挑战八位道馆馆主，对抗火箭队的阴谋，登顶城都联盟。通关并非故事终点，玩家将受邀参加四年一届的宝可梦世界杯，随后前往关都、橘子群岛继续游历。旅途之中会逐步发现宝可梦协会潜藏的内部问题，传说宝可梦不再只是简单的收集目标，各自背负完整的背景故事，主角会在数年的成长历程中揭开跨地区的隐秘真相，拥有多条支