为什么Luka小队和Conner会在封锁区被建造者攻击？

目前刚玩完Ilka的剧情，如果说Ilka在除役事件的最后已经修改亥伯里翁协定的内容为“沉睡者停止攻击人类并自毁”，那么为什么Luka小队、以及在Node13探索的Conner还会受到建造者攻击呢？协定内容不应该已经被修改了吗？难道是官方吃书？